Anthropic Claude Science intègre désormais NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit pour accélérer la recherche informatique en sciences de la vie.
Anthropic a lancé la version bêta publique de Claude Science, un atelier d’IA conçu pour la recherche scientifique. La plateforme permet aux scientifiques de converser directement avec des agents numériques en utilisant le langage naturel pour exécuter des flux de recherche de bout en bout. Ce système se connecte nativement au NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit, exposant les ressources informatiques hautes performances en tant que compétences appelables au sein de l’environnement Claude.
NVIDIA a créé ce que beaucoup considèrent comme la pile informatique accélérée par GPU la plus complète au monde contenant du matériel physique, des cadres logiciels, des bibliothèques opérationnelles, des modèles scientifiques, des microservices et des outils spécifiques à un domaine. Cette base matérielle et logicielle permet aux chercheurs d’exécuter des flux de travail sophistiqués et d’augmenter leurs vitesses d’itération.
L’intégration importe des modèles accélérés par NVIDIA, des bibliothèques de calcul et des microservices NVIDIA NIM dans l’environnement dans lequel les scientifiques mènent leurs recherches principales. 18 des 20 plus grandes sociétés pharmaceutiques mondiales déploient déjà NVIDIA BioNeMo dans leurs environnements de production, démontrant sa forte pénétration dans l’écosystème.
Claude Science traduit l’intention du langage naturel en action opérationnelle. Les chercheurs évitent de configurer manuellement des modèles prédictifs, de configurer des points de terminaison de réseau ou de gérer des environnements logiciels complexes. Le scientifique décrit une tâche de recherche spécifique – comme analyser une séquence génomique, prédire une structure protéique précise ou concevoir un liant moléculaire potentiel – et Claude Science interprète la demande en texte brut et orchestre l’exécution qui en résulte à l’aide d’agents préconfigurés et spécialisés dans un domaine.
Exécuter des flux de travail de conception moléculaire complexes
Ces agents spécialisés comprennent les protocoles de laboratoire et informatiques établis dans les domaines de la génomique, de la protéomique, de l’analyse unicellulaire, de la cheminformatique et de la recherche clinique. La boîte à outils NVIDIA fournit à ces agents scientifiques le contexte de données nécessaire pour mapper chaque étape opérationnelle à la capacité NVIDIA appropriée.
La boîte à outils regroupe les fonctions accélérées par NVIDIA sous forme de compétences programmatiques spécifiques et appelables. Il fournit aux agents des informations détaillées sur l’objectif exact de chaque outil spécifique et les entrées de données requises. Cette configuration permet à Claude Science de sélectionner le bon outil de calcul, de formater les entrées de données valides, d’exécuter le travail de traitement sur les ressources de calcul NVIDIA déployées et de renvoyer le résultat final pour examen humain.
L’intégration établit une boucle itérative rapide entre le raisonnement scientifique humain et le traitement informatique accéléré par la machine. Les scientifiques inspectent les résultats générés, affinent leurs requêtes spécifiques et déterminent les étapes ultérieures tout en restant entièrement concentrés sur la science fondamentale.
La production de meilleurs inhibiteurs pour des cibles cancéreuses courantes démontre l’application pratique de ce système déployé. Un scientifique lance le pipeline en identifiant une mutation connue de l’antigène cancérigène. Le chercheur demande ensuite à Claude de concevoir de nombreux inhibiteurs potentiels ciblant cette mutation spécifique. Claude Science travaille en tandem avec BioNeMo Agent Toolkit et les microservices NVIDIA NIM pour accélérer l’ensemble du pipeline de prédiction, d’optimisation et de validation ultérieure des inhibiteurs à haut débit.
Accélérer les pipelines de données unicellulaires et génomiques
La boîte à outils permet aux scientifiques d’accéder à des flux de travail accélérés et à des modèles ouverts avancés, notamment Evo 2, Boltz-2 et OpenFold3. Ces modèles offrent des capacités biomoléculaires alimentées par les bibliothèques logicielles NVIDIA, garantissant que l’agent autonome possède un modèle scientifique spécialement conçu pour chaque phase distincte du flux de travail.
Les agents d’IA ont besoin d’outils informatiques spécialisés pour raisonner, planifier et accomplir des tâches dans le domaine des sciences de la vie. Un seul flux de travail complet pourrait obliger l’agent à empreinter une bibliothèque massive de composés, à regrouper des résultats moléculaires prometteurs, à générer des conformères pour les meilleurs candidats structurels, à analyser le contexte génomique et à comparer les réponses aux perturbations avant de recommander la prochaine expérience physique en laboratoire.
Un agent fonctionne aussi vite que ses outils informatiques sous-jacents s’exécutent. Le NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit fournit à ces agents des outils accélérés pour fonctionner à une vitesse matérielle maximale. L’analyse génomique traitée via NVIDIA Parabricks passe de quelques heures à quelques minutes, ce qui permet à l’agent de prendre en compte un contexte génomique complexe dans les décisions opérationnelles en temps quasi réel.
L’outil RAPIDS-singlecell, développé par scverse, compresse un flux de travail de prétraitement et de clustering de 1,3 million de cellules de 52 minutes à 25 secondes. Cette réduction agressive de la vitesse transforme l’analyse monocellulaire en une partie active de la boucle de raisonnement de l’agent plutôt qu’en un travail par lots retardé et hors ligne. Le nvMolKit accélère jusqu’à 3 000 fois les tâches cheminformatiques telles que la recherche de similarité et la génération de conformères, fournissant ainsi des résultats rapidement lorsque l’agent itère dans des espaces chimiques massifs.
Standardiser les déploiements de production avec les microservices NIM
Les équipes ont besoin de mécanismes de déploiement stables pour ces pipelines de modélisation avancés. NVIDIA regroupe ses modèles biomoléculaires ouverts sous forme de microservices BioNeMo NIM. Ceux-ci fonctionnent comme des points de terminaison d’inférence prêts pour l’entreprise, adaptés aux environnements de production.
Les microservices sont entièrement conteneurisés et disposent d’une pile logicielle pré-intégrée, optimisée et accélérée conçue pour une inférence haute performance. L’agent autonome interagit avec une seule API stable pour déclencher ces déploiements de production à distance.
Le NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit reste ouvert et indépendant des harnais. Cette conception architecturale garantit que les mêmes compétences scientifiques fonctionnent de manière cohérente dans différents cadres d’agents et plates-formes de recherche d’entreprise indépendantes.
Les équipes d’ingénierie peuvent télécharger la boîte à outils et les compétences scientifiques associées via les ressources de développement NVIDIA et les référentiels de code GitHub. Pendant la phase bêta publique active, Anthropic demande des commentaires directs aux chercheurs concernant les intégrations logicielles nécessaires et aux spécialistes du domaine supplémentaires.
